我院脑科中心由神经内科、神经外科和心身医学科组成。是浙南闽北地区最具实力的神经系统疾病诊疗中心，该中心主任：郑荣远，副主任：郑伟明、邵蓓、何金彩、张旭。

　　该中心现有专业医师46人，其中高级职称17人，中级7人，博士5人，硕士18人，硕导8人，博导1人。另有神经专业麻醉师4人，专业护士6人，立体定向专业人员2人。

　　神经科是我省神经病学专业教学、科研、医疗中心之一。曾获五项省部级以上科研成果奖，拥有神经病学硕士点，神经药物流行病学研究中心和实验神经生物学研究所等教学和科研机构，已成为浙江省医学重点学科和省教委重点扶植建设学科、国家新药临床研究基地。现开设神经科急诊观察室，脑血管病区（卒中单元），神经监护病房及神经科普通病区，实际开放床位数100张，年收治神经科重症2400多例，日门诊量达260—480人次。神经科以危重病的救治和神经专病诊疗为特色：
　　① 脑血管病诊疗中心，开设脑血管病专病门诊、建立30张病床的卒中单元和普通中风病房，实行卒中规范化诊治；开展高血压脑出血的抽吸治疗、脑梗死的溶栓、降纤、抗凝、介入治疗，脑卒中的早期康复治疗和二级预防治疗等新治疗项目。
　　② 癫痫诊治新技术：开设癫痫专病门诊，开展癫痫的规范化诊疗、脑电监护以及难治性癫痫的新药和手术治疗。
　　③ 神经肌肉病诊治新技术：开设神经肌肉疾病门诊；开展皮层、脑干、视觉、体感诱发电位及肌电图检测技术，海绵体肌反射、肛门括约肌肌电图、Blink反射新技术在诊疗中的应用。
　　④ 神经免疫病诊疗新技术：开设神经免疫疾病门诊，开展重症肌无力、脱髓鞘疾病、GBS等免疫诊断新项目和神经免疫治疗新方法。
　　⑤ 神经变性疾病的诊治研究：开设老年性痴呆、帕金森病的专病门诊，开展痴呆和帕金森病的新药疗法的应用。
　　⑥ 神经心理与心理障碍的诊治。开设神经心理、心理咨询、睡眠障碍门诊，开展各项心理障碍量表检测、心理治疗和言语障碍的诊断与早期康复治疗等。
　　神经外科系浙江省医学重点学科，省教育厅重点扶植学科，温州医学院重点扶植学科。先后建立了“NICU”和脑立体定向研究室，并正在筹建“浙江省定向和功能神经外科研究中心”和“神经外科研究室”。医院配备了高速颅钻、蛇牌电刀、颅内压监护仪等医疗仪器设备，特别是近年来又购置BrainLab神经导航系统、F. L. Fischer立体定向仪和射频仪、Oxford视频监护皮层脑电图、蛇牌神经内窥镜、蔡司显微镜（N-3F）等设备和俄罗斯的显微外科手术器械，为科室的进一步发展提供了雄厚的物质基础。该科除了常规开展各类重型颅脑损伤的手术抢救工作和常规中枢神经疾病的手术治疗外，还开展了各种高难度的脑部手术，如巨大脑动脉瘤夹闭切除术、中大型和深部动静脉畸形（AVM）切除术、脑干和脊髓内肿瘤、海绵窦肿瘤、斜坡肿瘤、枕大孔腹侧肿瘤、颅内外沟通肿瘤切除术，以及听神经瘤、垂体瘤、颅底脑膜瘤、脑室内肿瘤切除术、颅神经微血管减压术、颈内动脉血管外膜剥脱术、小脑扁桃体下疝畸形和脊髓空洞症的手术治疗、动脉瘤和AVM血管内栓塞术等，手术质量均已达到国内先进水平。显微神经外科、颅底神经外科、立体定向神经外科手术和血管内介入技术全面开展，已经形成该科的技术优势，是浙南闽北地区神经外科临床教学科研中心。
    目前，该科正进一步开展微创神经外科手术，现已成功开展立体定向或神经导航引导下显微外科手术治疗脑深部肿瘤，大大提高了手术的成功率和安全性，是90年代末国际先进技术；神经内窥镜辅助下切除巨大斜坡胆脂瘤获得成功；开展了神经内窥镜下脑室内囊肿、血肿、脑内血肿的治疗；视频皮层脑电图监护下显微外科手术治疗难治性癫痫；与放射科合作在我省乃至我国率先开展功能核磁共振（FMRI）引导显微神经外科手术切除功能区肿瘤的临床研究，并取得了良好的效果，此项技术国际上仍在研究之中；脑干血肿立体定向抽吸术有了新的进展；大脑恶性胶质瘤可逆性开放血脑屏障后颈动脉内化学治疗正在进行。
    精神科门诊设在医疗保健中心九楼，病房在住院部十一楼。现有临床医师6人，技术员4人，包括高级职称2人，博士硕士3人。配备有含12个终端的网络型心理测评系统以及生物反馈诊疗系统等先进设备。诊疗范围涵盖了情感障碍、神经症、失眠症、痴呆、精神分裂症等常见精神心理问题，并专门设立了心身疾病、睡眠障碍、儿童精神心理等专科门诊，采用药物治疗、心理治疗、生物反馈治疗等多种方法治疗各种疾病。